Strain identifier

BacDive ID: 6332

Type strain: No

Species: Kofleria flava

Strain Designation: Pl vt10

Strain history: <- H. Reichenbach; Pl vt10

NCBI tax ID(s): 694315 (species)

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General

@ref: 5404

BacDive-ID: 6332

DSM-Number: 14602

keywords: 16S sequence, Bacteria

description: Kofleria flava Pl vt10 is a bacterium that was isolated from soil with decaying plant material.

NCBI tax id

  • NCBI tax id: 694315
  • Matching level: species

strain history

  • @ref: 5404
  • history: <- H. Reichenbach; Pl vt10

doi: 10.13145/bacdive6332.20240510.9

Name and taxonomic classification

LPSN

  • @ref: 20215
  • description: domain/bacteria
  • keyword: phylum/pseudomonadota
  • domain: Bacteria
  • phylum: Pseudomonadota
  • class: Deltaproteobacteria
  • order: Myxococcales
  • family: Kofleriaceae
  • genus: Kofleria
  • species: Kofleria flava
  • full scientific name: Kofleria flava (ex Kofler 1913) Reichenbach 2007

@ref: 5404

domain: Bacteria

phylum: Proteobacteria

class: Deltaproteobacteria

order: Myxococcales

family: Kofleriaceae

genus: Kofleria

species: Kofleria flava

full scientific name: Kofleria flava (ex Kofler 1913) Reichenbach 2007

strain designation: Pl vt10

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Morphology

multimedia

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5404https://www.dsmz.de/microorganisms/photos/DSM_14602.jpgswarm, contracting swarm rips open the agar© Leibniz-Institut DSMZ

Culture and growth conditions

culture medium

  • @ref: 5404
  • name: VY/2 AGAR (DSMZ Medium 9)
  • growth: yes
  • link: https://mediadive.dsmz.de/medium/9
  • composition: Name: VY/2 AGAR (DSMZ Medium 9) Composition: Agar 15.0 g/l Baker's yeast 5.0 g/l CaCl2 x 2 H2O 1.36 g/l Vitamin B12 0.0005 g/l Distilled water

culture temp

  • @ref: 5404
  • growth: positive
  • type: growth
  • temperature: 30

Isolation, sampling and environmental information

isolation

  • @ref: 5404
  • sample type: soil with decaying plant material
  • geographic location: Arizona, Holbrook
  • country: USA
  • origin.country: USA
  • continent: North America

isolation source categories

Cat1Cat2Cat3
#Environmental#Terrestrial#Soil
#Host#Plants#Decomposing plant

taxonmaps

  • @ref: 69479
  • File name: preview.99_113993.png
  • url: https://microbeatlas.org/index.html?action=taxon&taxon_id=90_15848;96_29919;97_56685;98_77173;99_113993&stattab=map
  • Last taxonomy: Kofleria
  • 16S sequence: HF937255
  • Sequence Identity:
  • Total samples: 1540
  • soil counts: 1176
  • aquatic counts: 135
  • animal counts: 103
  • plant counts: 126

Safety information

risk assessment

  • @ref: 5404
  • biosafety level: 1
  • biosafety level comment: Risk group (German classification)

Sequence information

16S sequences

  • @ref: 20218
  • description: Kofleria flava partial 16S rRNA gene, strain DSM 14602
  • accession: HF937255
  • length: 1475
  • database: nuccore
  • NCBI tax ID: 694315

External links

@ref: 5404

culture collection no.: DSM 14602

straininfo link

  • @ref: 75806
  • straininfo: 297596

Reference

@idauthorscataloguedoi/urltitlejournalpubmed
5404Curators of the DSMZLeibniz Institut DSMZ-Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen GmbH (DSM 14602)https://www.dsmz.de/collection/catalogue/details/culture/DSM-14602
18281Reichenbach, H.Collection description and documentation of myxobacteria by H. Reichenbach, HZI (formerly GBF); Collection curr. located at the DSMZ
20215Parte, A.C., Sardà Carbasse, J., Meier-Kolthoff, J.P., Reimer, L.C. and Göker, M.10.1099/ijsem.0.004332List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN) moves to the DSMZ
20218Verslyppe, B., De Smet, W., De Baets, B., De Vos, P., Dawyndt P.10.1016/j.syapm.2013.11.002StrainInfo introduces electronic passports for microorganisms.Syst Appl Microbiol. 37: 42-50 201424321274
69479João F Matias Rodrigues, Janko Tackmann,Gregor Rot, Thomas SB Schmidt, Lukas Malfertheiner, Mihai Danaila,Marija Dmitrijeva, Daniela Gaio, Nicolas Näpflin and Christian von Mering. University of Zurich.https://microbeatlas.org/MicrobeAtlas 1.0 beta
75806Reimer, L.C., Lissin, A.,Schober, I., Witte,J.F., Podstawka, A., Lüken, H., Bunk, B.,Overmann, J.10.60712/SI-ID297596.1StrainInfo: A central database for resolving microbial strain identifiers